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How (not) to use PubMed

22. November 2018 | Martina Gosteli | Keine Kommentare |

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PubMed besitzt eingebaute Funktionen, die einen bei der Literatursuche unterstützen, ausser man schaltet sie (unbeabsichtigt) aus. Hier zeigen wir ihnen, wo sie sehen, wie PubMed ihre Suche umsetzt, was Medical Subject Headings (Schlagworte) sind und wie sie Suchbegriffe hervorheben können.

 

Wie man das Automatic Term Mapping nicht (aus Versehen) ausschaltet

Wenn man Suchbegriffe ins Suchfeld eingibt, verwendet PubMed ein Automatic Term Mapping (ATM) Funktion, um nach Schlagworten (Medical Subject Headings; MeSH), Journals oder Autoren zu suchen. Wie PubMed die eingegebenen Suchbegriffe interpretiert, sieht man in der rechten Spalte unter den Suchdetails (meist muss man herunterscrollen und „See more…“ anwählen).

Allerdings geschieht dies nicht, wenn man Trunkierungen, Anführungszeichen oder Feldbezeichnungen (z.B. Titel und Abstract [tiab]) verwendet. Daher verringert sich dann die Trefferzahl.

 

Medical Subject Headings (MeSH): eingebauter Thesaurus mit kontrolliertem Vokabular

MeSH ist ein Thesaurus mit kontrolliertem Vokabular und erlaubt das Indexieren (und Auffinden) von Artikeln auf eine einheitliche Art. Die MeSH sind hierarchisch aufgebaut. Hier sehen das das Beispiel der „nutritional sciences“. Normalerweise empfiehlt es sich, in der Suchstrategie MeSH und Stichwörter zu kombinieren.

 

Persönliche Einstellungen in My NCBI

Hat man seine Suchstrategie einmal optimiert, sollte man diese abspeichern: Entweder in einem persönlichen Konto (My NCBI), als pdf-File oder indem man die Suchdetails in ein Textdokument kopiert. Es ist nämlich sehr schwierig, einen genauen Suchstring später genau nachzubilden.

Um ein persönliches Konto zu eröffnen, wählen sie „Sign in to NCBI“ in der Ecke oben rechts und melden sie sich an. Jetzt können sie ihre persönlichen Einstellungen anpassen (My NCBI -> NCBI Site Preferences -> z.B. Highlighting in Aqua) und eine Suche abspeichern (-> advanced search builder -> die Nummer anklicken -> Save in My NCBI).

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